โดย…ดร.นิพนธ์ เอี่ยมสุภาษิต

ด้วยความพยายามร่วมกัน ซึ่งประกอบด้วย Earlham Institute, Roslin Institute และ WorldFish ทำให้สามารถพพัฒนาจีโนมอ้างอิงที่มีคุณภาพสูงเต็มรูปแบบเป็นครั้งแรกเพื่อการปรับปรุงพันธุกรรมปลานิล ทรัพยากร (ข้อมูล) พื้นฐานนี้จะเป็นประโยชน์ต่อนักปรับปรุงพันธุ์ปลาที่ต้องการพัฒนาสายพันธุ์ที่มีขนาดใหญ่ขึ้น เติบโตอย่างรวดเร็ว และมีความยืดหยุ่นต่อความท้าทายด้านสิ่งแวดล้อมของโลกที่ร้อนขึ้น

โครงการ Genetically Improved Farmed Tilapia (GIFT) (โครงการพัฒนาพันธุกรรมเพื่อการเพาะเลี้ยงปลานิล) ซึ่งนำโดย WorldFish ได้พัฒนาสายพันธุ์ปลานิลชั้นยอดที่พบเห็นได้ในปัจจุบันและเผยแพร่ไปทั่วโลก โดยผ่านการคัดเลือกพันธุ์ที่ยังไม่มีจีโนมที่ใช้ในการอ้างอิงที่สมบูรณ์ เพื่อเร่งการพัฒนาสายพันธุ์ GIFT ที่ได้รับการปรับปรุงผ่านการคัดเลือกจีโนม

นักวิจัยจากสถาบัน Earlham และ Roslin ได้ทำงานเพื่อสร้างจีโนมที่ใช้อ้างอิงคุณภาพสูงที่ใกล้สมบูรณ์จากเนื้อเยื่อที่ WorldFish จัดหาให้ จีโนมดังกล่าวได้รับการอธิบายประกอบโดยใช้แนวทางล้ำสมัยที่พัฒนาโดย Swarbreck Group ที่ Earlham Institute

เดิมทีสายพันธุ์ GIFT ได้รับการพัฒนาจากการผสมผสานระหว่างสายพันธุ์ปลานิลเชิงพาณิชย์และปลานิลธรรมชาติ รวมทั้งการผสมข้ามสายพันธุ์กับสายพันธุ์อื่น ด้วยการใช้จีโนมของสายพันธุ์ที่เกี่ยวข้องกันอย่างใกล้ชิด ซึ่งรวมถึง Oreochromis mossambicus (ปลานิลโมซัมบิก) และ O. aureus (ปลาน้ำจืดชนิดหนึ่ง ในวงศ์ปลาหมอสี)

ทำให้สามารถเปิดเผยขอบเขตที่สารพันธุกรรมอาจส่งผ่านระหว่างสายพันธุ์ต่าง ๆ ในอดีต และระบุตำแหน่งเฉพาะใน GIFT จีโนม และพบได้มากกว่า 11 ล้านเบสของสารพันธุกรรมในจีโนมของ O. mossambicus ที่อยู่ภายในจีโนม GIFT รวมถึงยีนที่เกี่ยวข้องกับภูมิคุ้มกันและอัตราการเติบโต การค้นพบนี้จะเป็นประโยชน์ในโครงการปรับปรุงพันธุ์ในอนาคต

ครับ การปรับปรุงพันธุ์ในระดับโมเลกุลมีศักยภาพสูงไม่ว่าจะเป็นพืช ปศุสัตว์ และปลา

อ่านเพิ่มเติมได้ที่ https://www.earlham.ac.uk/news/key-tilapia-genome-offers-boost-global-food-security